يعتقد البعض أنهم يمتلكون قناة معوية صحية إلا أن أسلوب الحياة والعوامل البيئية يمكن أن تلحق الضرر بالجهاز الهضمي. وهذا يسمح للبكتيريا الضارة في البقاء والتسبب في العديد من المشاكل. من هذه العوامل عادات الأكل السيئة وماء الشرب الذي يحتوي على الكلور والإجهاد وتناول العديد من المضادات الحيوية وغيرها الكثير بما في ذلك المشاكل الصحية والشيخوخة والتي تعمل على تقليل نسبة البكتيريا النافعة. عندما تصبح نسبة البكتيريا النافعة والضارة غير متوزانة تبدأ العديد من المشاكل بالظهور مثل سوء امتصاص العناصر الغذائية والتسمم المعوي. وهذا يؤدي إلى حدوث غازات وانتفاخ وإسهال وإمساك وغيرها. إذا لم يتم معالجة الحالة قد تصبح الأعراض مزمنة وقد تهدد الجهاز المناعي وتؤدي للإصابة بأمراض خطيرة.